با چه سرعتی دانشمندان می توانند گونه های جدید ویروس کرونا را پیدا کنند؟


بر اساس GISAID ، از بیش از 21.5 میلیون مورد Covid-19 که به طور رسمی در ایالات متحده گزارش شده است ، نمونه ها فقط از 59،438 نفر ، یا کمتر از 0.3 درصد بود ، برای انواع مختلف توالی و تجزیه و تحلیل شدند. در مقابل ، انگلیس به طور منظم بیش از 10 درصد از موارد Covid-19 خود را تشکیل می دهد. این امر به مقامات بهداشت عمومی انگلیس امکان داد تا به موقع نظارت کنند ، زیرا گزینه B.1.1.7 از یک یافته نادر در اوایل دسامبر به غلبه عفونت های جدید سه هفته بعد تبدیل شد. ممکن است انگلیسی ها در این زمینه مثال برجسته ای باشند ، اما آنها تنها نیستند. با توجه به اخیر واشنگتن پست تجزیه و تحلیل ، 42 کشور دیگر موارد بیشتری را از ایالات متحده بررسی کرده اند ، با وجود این واقعیت که آمریکایی ها یک چهارم کل ویروس های کرونا را در سراسر جهان تشکیل می دهند.

چیو گفت: “کاری که اکنون ایالات متحده انجام می دهد کاملاً ناکافی است.” وی معتقد است که مقامات دولت آمریکا باید روی این آستانه 10 درصد تمرکز کنند. اما تلاش ها بدون شک با شکسته شدن سیستم مراقبت های بهداشتی در ایالات متحده پیچیده خواهد شد. در انگلستان ، که دارای یک سرویس بهداشتی ملی و یک سرویس میکروبیولوژیکی پشتیبانی است ، انتقال نمونه ها و داده ها نسبتاً آسان است. در ایالات متحده ، بخش خصوصی هنوز بر بازار آزمایش تسلط دارد. برای اینکه یک نمونه در آزمایشگاه چیو ظاهر شود ، او می گوید قبل از رسیدن به او باید از یک آزمایشگاه تجاری به آزمایشگاه شهرستان و سپس به آزمایشگاه دولتی برود. این اتفاق ممکن است هفته ها طول بکشد – در صورتی که اصلاً اتفاق بیفتد. اغلب زمانی که متخصص اپیدمیولوژی در بخش بهداشت عمومی با پرونده ای روبرو می شود که می خواهد با استفاده از ژنتیک آن را بررسی کند ، نمونه اصلی قبلاً کنار گذاشته شده است. “مرحله محدودیت سرعت توالی نیست. او واقعاً نمونه را می گیرد ، “چیو می گوید. “به همین دلیل ما باید آزمایشگاه های ایالتی و شهرستان را برای انجام این کار در داخل توانمند کنیم تا بتوانیم داده ها را سریعتر بازیابی کنیم.”

طی دهه گذشته ، آزمایشگاه های بهداشت عمومی توانایی تعیین توالی خود را به عنوان بخشی از نقش خود در ردیابی شیوع بیماری های منتقله از غذا در ایالات متحده افزایش داده اند. به گفته وروبلسکی ، هر آزمایشگاه ایالتی و همچنین تعدادی آزمایشگاه بزرگ منطقه ای دارای فناوری هستند که به راحتی در دسترس هستند. وی گفت ، اما آنها در هنگام شیوع همه گیر موفق به استفاده از آن نشدند زیرا آنها دستان خود را پر می کردند ، فقط سعی در انجام آزمایشات تشخیصی اولیه و ردیابی تماس داشتند. و تا همین چند هفته پیش به آنها دستور داده نمی شد که کار دیگری انجام دهند.

اما این بالاخره شروع به تغییر می کند.

در اواسط ماه دسامبر ، CDC 15 میلیون دلار برای آزمایشگاه های بهداشت عمومی کشور جهت افزایش نتایج توالی در سراسر کشور منتشر کرد. این بخشی از تلاش های چند جانبه ای بود که اکنون در آژانس برای افزایش تعداد ویروس های کرونا و سایت هایی که از آنها گرفته شده است ، انجام می شود. این پول به کشورها کمک می کند تا در یک برنامه نظارت بر فشار ویژه SARS-CoV-2 به نام NS3 شرکت کنند که CDC در ماه نوامبر راه اندازی کرد. هنگامی که این برنامه کاملاً عملیاتی است ، انتظار می رود آزمایشگاه های بهداشت عمومی هر هفته 10 نمونه ویروس کرونا را که به طور تصادفی انتخاب شده اند به آزمایشگاه های CDC در آتلانتا ارسال کنند. نمونه ها باید نمایانگر بیماران در سنین مختلف ، گروه های نژادی و قومی و همچنین تنوع جغرافیایی هر کشور باشند. علاوه بر توالی ، دانشمندان CDC از این نمونه ها برای ساختن یک کتابخانه متمرکز از سویه ها استفاده می کنند که می توانند در آنها غوطه ور شوند و آزمایشات اضافی را انجام دهند.

گریگوری آرمسترانگ ، رئیس سرویس تشخیص پیشرفته مولکولی CDC ، گفت: “توالی چیزهای زیادی به ما می گوید ، اما نمی تواند همه چیز را به ما بگوید.” به عنوان مثال ، یکی از نگرانی های متخصصان بهداشت عمومی این است که افراد دارای ایمنی قبلی که در جنگ قبلی با Covid-19 به دست آمده اند ، چطور قادر به دفع عفونت های این ایالت جدید در انگلیس هستند. برای آزمایش آن ، دانشمندان باید بتوانند ارزیابی کنند که آنتی بادی های موجود در خون بازماندگان Covid-19 چقدر به نسخه B.1.1.7 ویروس حمله می کنند و خنثی می کنند. احتمال نگران کننده دیگر این است که واکسن هایی که تاکنون تولید و مجاز شده اند ، در برابر سویه های در حال ظهور موثر نیستند. آرمسترانگ گفت: “ما باید كتابخانه ای از گزینه ها را برای دریافت این پاسخ ها داشته باشیم.”

جلد کامل ویروس کرونا را اینجا بخوانید.

برنامه NS3 ، که آرمسترانگ انتظار دارد تا پایان ماه به طور کامل عملیاتی شود ، کمک خواهد کرد. اما این اطلاعات داده های ژنتیکی مورد نیاز مقامات بهداشت عمومی در ایالات متحده را برای پیگیری پیشرفت B.1.1.7 و سایر گونه های در حال ظهور مانند مضطرب ، که از آفریقای جنوبی ناشی می شود ، از طریق جمعیت آمریکا ارائه نمی دهد. به همین دلیل CDC آزمایشگاه های بزرگ آزمایش تجاری را نیز ارائه می دهد. در ماه دسامبر ، آژانس قراردادهایی را با LabCorp و Illumina امضا کرد و در حال مذاکره در مورد معاملات بیشتر با دیگر افرادی است که توانایی گرفتن و سفارش نمونه از سراسر کشور را دارند. علاوه بر این ، از ماه سپتامبر CDC حدود 8 میلیون دلار به مراکز توالی آکادمیک اختصاص داده است و در حال حاضر به دنبال معرفی سایت های اضافی به صورت آنلاین است. اطلاعات حاصل از تمام این تلاشها بطور مداوم توسط دانشمندان CDC مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته و در پایگاههای اطلاعاتی عمومی مانند GISAID بارگذاری می شود تا توسط محققان دیگر استفاده شود.


منبع: sadeh-news.ir

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>